“十五”国家科技攻关计划(2004BA526B0403)
- 作品数：2 被引量：50H指数：2
- 相关作者：夏德全董志国吴婷婷孟学平程汉良更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏省海洋水产研究所淮海工学院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 6种帘蛤科贝类及4个地理种群文蛤线粒体COI基因片段序列分析被引量：40
- 2007年
- 对文蛤（Meretrix meretrix L.,1758）、青蛤（Cyclina sinensis G.,1791）、硬壳蛤（Mercenaria mercenaria L.,1758）、江户布目蛤（Protothaca jedoensis L.,1874）、薄片镜蛤（Dosinia corrugata R.,1850）和菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum A.,1850）6种帘蛤科贝类和4个地理种群文蛤（大连、连云港、湛江、防城港）的细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因片段的核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、种群遗传结构和分子系统发生研究中的应用价值.测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为709 bp,序列A＋T含量（62.2%-67.6%）明显高于GC含量.物种间共有变异位点311个,其中简约信息位点202个;文蛤4个地理种群间共有变异位点46个,其中简约信息位点2个.此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点85个;文蛤种群间只有1个氨基酸变异位点.以COⅠ基因片段序列为标记,用大竹蛏（Solen grandis）作外群,构建了帘蛤科贝类的系统发生树,其拓扑结构显示4个地理种群文蛤首先聚为1个单元,然后与青蛤聚在一起,最后所有帘蛤科物种聚为一枝,与外群相区别,其结果与传统形态分类基本一致,说明COⅠ基因适合作为该科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记.
- 程汉良夏德全吴婷婷孟学平吉红九董志国陈淑吟
- 关键词：帘蛤科线粒体DNA系统发生学
- 帘蛤科4种养殖蛤群体遗传多样性和种间关系的fAFLP分析被引量：11
- 2008年
- 利用荧光标记扩增片段长度多态性（fAFLP）技术对文蛤（Meretrix meretrix）、青蛤（Cyclina sinensis）、菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum）和硬壳蛤（Mercenaria mercenaria）4种帘蛤科贝类的群体遗传多样性和种间关系进行了研究。选择EcoRⅠ／MseⅠ进行酶切，使用6个E＋3／M＋3引物组合进行扩增，共获得1096个位点，多态位点比率95．1％，片段长度50-456bp。其中，文蛤、青蛤、菲律宾蛤仔和硬壳蛤分别得到681，715，702和694个位点，相应的多态位点比率为76．8％，81．7％，83．0％和75．1％，得到17个种特异性位点，可作为4物种特征标记。分析了群体遗传相似系数和遗传多样性指数以及种间遗传相似系数。结果表明，硬壳蛤群体遗传相似系数最高（0．6709），遗传多样性指数最低（0．2360）；菲律宾蛤仔群体遗传相似系数最低（0．5925），遗传多样性指数最高（0．2618）；根据遗传相似系数采用UPGMA法构建了4物种32个体的聚类图，表明文蛤与菲律宾蛤仔遗传关系最近，青蛤与其他3物种遗传关系较远。
- 彭永兴程汉良夏德全吴婷婷孟学平吉红九董志国
- 关键词：物种鉴定
