郑宽瑜 作品数:47 被引量:136 H指数:7 供职机构: 云南省农业科学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 云南省科技计划项目 更多>> 相关领域: 农业科学 轻工技术与工程 生物学 医药卫生 更多>>
植物病毒粒体在寄主细胞中的原位聚集特征 被引量:7 2019年 病毒粒体的原位聚集特征是快速诊断植物病毒及研究其系统侵染的基础,但国内外对此研究和报道较少。本研究采用马铃薯Y病毒属病毒、烟草花叶病毒、番茄斑萎病毒属病毒、水稻矮缩病毒、黄瓜花叶病毒等不同形态的植物病毒自然感染或人工接种的植株样品,比较了研磨过滤、蔗糖密度梯度离心、切片浸渍法、超薄切片与高压冷冻等不同电镜制样方法观察效果。结果表明,以本实验室发明的切片浸渍(原生质体裂解)法负染色制样与超薄切片制样透射电镜观察,可以得到线状、杆状和被膜球状植物病毒粒体在寄主细胞中的典型原位聚集特征,借此可区分不同属或种,对植物病毒的快速诊断鉴定具有重要参考价值。在此基础上,对应用植物病毒粒体原位聚集特征深入研究病毒复制、装配与运动的机制进行探讨,为植物病毒的系统侵染机理研究提供依据。 张仲凯 郑宽瑜 王田田 吴少政 裴卫华关键词:透射电镜 西藏昌都市卡若区蔬菜主要病毒检测及番茄斑萎病毒鉴定 2023年 为明确西藏昌都市卡若区高原条件下的蔬菜主要病毒种类,对温室、大棚和露地栽培的主要蔬菜进行了病毒病调查,采集典型病毒病症状样品进行ELISA检测,明确病毒种类;并利用电子显微镜观察,RT-PCR扩增克隆与测序分析对主要病毒进行鉴定分析。ELISA检测结果表明,西藏昌都市卡若区温室及大棚栽培的番茄、辣椒和莴苣上的主要病毒有番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus,TSWV)、马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)及凤果花叶病毒(pepino mosaic virus,PepMV)。其中TSWV检出率最高,为45%。进一步对检出TSWV的蔬菜样品进行电子显微镜观察,发现其中含有典型的正番茄斑萎病毒属Orthotospovirus病毒粒体,应用TSWV-N基因特异性引物进行RT-PCR扩增克隆和序列分析,发现西藏昌都市卡若区蔬菜感染的TSWV与云南TSWV分离株亲缘关系最近。本研究结果明确了西藏昌都市卡若区蔬菜的主要病毒种类。综合抗体检测、病毒粒体形态观察与分类相关基因的克隆测序结果,明确了西藏昌都市卡若区蔬菜感染的主要病毒为TSWV。这也是TSWV在西藏的首次报道,为了解TSWV的发生分布及其防控提供了依据。 郑宽瑜 熊智琦 魏治镭 吴阔 王茂森 苏晓霞 巴宗 次仁措姆 王田田 张仲凯关键词:番茄 辣椒 莴苣 番茄斑萎病毒 一种番茄斑萎病毒属病毒基因及其应用 本发明公开了一种番茄斑萎病毒属病毒即辣椒黄花环斑病毒基因序列(包括RNA或DNA分子)及其应用。所述的病毒基因序列的碱基序列如SEQ ID NO:1所示,能够编码病毒的核壳体蛋白(N)及非结构蛋白(NSs);或所述的病毒... 董家红 郑宽瑜 张仲凯 吴阔 张丽珍番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)云南建水分离物鉴定及全基因组序列分析 2025年 番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)近年来在全球番茄产区快速发生蔓延,造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似ToBRFV感染的症状,并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似ToBRFV感染的番茄果实样品进行电子显微镜观察及RT-PCR检测鉴定,并进一步对分离株进行全基因组测序分析,构建系统进化树分析其与其它ToBRFV分离株的进化关系。结果表明,从感病的番茄果实上发现杆状病毒粒体,大小约18 nm×300 nm,具有烟草花叶病毒属病毒的典型形态特征;用ToBRFV特异性检测引物进行RT-PCR扩增得到591 bp目的片段,经NCBI blast比对,与ToBRFV具有最高一致率(达99%以上),将该分离株命名为ToBRFV-2022-JS(GenBank登录号:OR593752)。测序发现ToBRFV-2022-JS基因组全长6386 nt,具有4个ORFs,分别编码126 kDa和183 kDa复制酶,30 kDa运动蛋白MP和17.5 kDa外壳蛋白CP。进化树分析显示该分离株与ToBRFV银川分离株(GenBank登录号:OR500698.1)的亲缘关系最近,核苷酸序列一致率为99.73%。上述结果表明云南建水番茄果实受到ToBRFV感染。该结果为ToBRFV在云南番茄产区的监测与防控提供了依据。 肖雨晴 吕高莹 李树军 陈永对 苏晓霞 杨李源滨 周晓罡 余大朝 王田田 郑宽瑜 张仲凯关键词:系统进化分析 金沙江干热河谷地区贡菜生理性病害和药肥害识别与防治技术 2024年 金沙江干热河谷地区是新兴的贡菜优势产区,在高种植效益的驱动下,种植户常年连作和粗放管理成为普遍现象,导致贡菜连作障碍等生理性病害、药肥害日趋严重。通过科学识别贡菜生理性病害及药肥害,分析产生的原因,提前采取相应的栽培管理措施进行预防,可提高贡菜品质,确保贡菜产业的健康发展。 陈侃 郑宽瑜 李进斌 黄文科 张艳明 邵宏婷关键词:金沙江干热河谷 贡菜 生理性病害 番茄斑萎病毒运动蛋白NSm的原核表达及抗体制备 被引量:2 2015年 将番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)运动蛋白NSm基因克隆到原核表达载体pET-32a(+)中,利用大肠杆菌系统表达NSm蛋白,以Ni^(2+)-NTA agarose亲和柱纯化该蛋白与His组氨酸的融合蛋白,免疫家兔制备融合蛋白多克隆抗体。Western blot检测显示,该抗体与NSm重组蛋白以及普通烟病叶中的NSm蛋白具有特异性反应。采用该抗体对TSWV感染的普通烟叶片低温超薄切片进行免疫胶体金标记,透射电镜观察发现特异性金颗粒主要定位在病叶细胞的胞间连丝中,而健康烟草叶片组织中没有金颗粒特异性标记。结果表明,该抗体可用于研究NSm在细胞中的定位。 尚卫娜 郑宽瑜 董家红 张仲凯 洪健 周雪平关键词:番茄斑萎病毒 番茄环纹斑点病毒Gn蛋白的原核表达及多抗血清制备 被引量:1 2017年 通过生物信息学预测,番茄环纹斑点病毒(Tomato zonate spot virus,TZSV)Gn蛋白为跨膜蛋白,有3个跨膜结构域,抗原表位预测发现非跨膜区包含有较高的抗原指数区域,因此选择Gn蛋白的非跨膜区进行原核表达及多抗血清制备。用特异性引物,通过RT-PCR从感染TZSV的番茄中扩增出部分Gn基因片段,将获得的片段构建到原核表达载体pET-30a中,获得原核表达载体pET-30a-Gn,转化大肠杆菌BL21(DE3),用IPTG诱导表达。SDS-PAGE电泳分析显示,高效诱导表达了40 kD融合蛋白。用回收纯化的融合蛋白免疫家兔,获得多抗血清。间接ELISA测定多抗血清的效价为1/16 384。利用制备好的抗血清对感染TZSV的病样进行Western blotting检测,能检测到特异性条带。结果表明该抗血清特异性良好,可用于TZSV Gn相关的免疫反应实验。 郑宽瑜 尚卫娜 张洁 郑雪 董家红关键词:原核表达 抗血清 一株深绿木霉菌菌株及其在防治三七根腐病中的应用 本发明公开了一株深绿木霉菌菌株及其在防治三七根腐病中的应用。本发明的深绿木霉菌菌株,所述的深绿木霉菌菌株为PRWS21,保藏名称为深绿木霉菌Trichoderma atroviride,保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会... 郑宽瑜 魏治镭 张仲凯 苏晓霞 郑雪 周凤 陈永对 吴阔番茄斑萎病毒属病毒非结构蛋白NSs的生物信息学分析 被引量:1 2014年 番茄斑萎病毒属(Tospovirus)病毒编码的非结构蛋白NSs,可能在病毒复制、转录、抑制RNA沉默中起重要作用,本文利用生物信息方法对21个Tospovirus病毒成员的NSs序列进行分析,为进一步研究NSs的功能提供参考信息。从GenBank数据库中下载NSs基因序列,用DNAMAN5.0做NSs相似性矩阵分析,发现一些Tospovirus病毒成员之间的NSs氨基酸序列相似性很低,最低仅为7.1%;用ClustalX2.1进行NSs的氨基酸多序列比对分析,发现Tospovirus病毒成员的NSs相对保守区主要位于NSs的C端的位置,高度保守的氨基酸位点共有9个;PROSITE对NSs进行模体预测分析,结果显示Tospovirus病毒NSs共有的蛋白修饰:C蛋白激酶磷酸化、酪蛋白激酶II磷酸化和N-酰基化。此外,不同种的Tospovirus病毒NSs模体也表现出了多样性的特点。预测结果为下一步研究NSs功能奠定了基础。 郑宽瑜 董家红 苏晓霞 方琦 郑雪 张仲凯关键词:番茄斑萎病毒属 非结构蛋白 NSS 生物信息学 单头西花蓟马总RNA提取方法的比较研究 被引量:1 2017年 Tri Pure法和RNA提取试剂盒法是目前实验室动植物RNA提取的常用方法。本试验通过对两种不同的RNA提取试剂盒与Tri Pure法进行比较,发现Trans公司研发的型号为ER501-01的Trans Zol Up Plus RNA Kit试剂盒适合提取单头西花蓟马总RNA,所得到的RNA纯度和浓度都比较高。该研究结果为通过分子手段研究蓟马等小型昆虫提供理论基础。 徐弢 苏晓霞 张晓林 陈永对 郑雪 郑宽瑜 陈勇 赵立华 刘小烛 张洁关键词:西花蓟马 总RNA