贾孟文
- 作品数:9 被引量:16H指数:3
- 供职机构:内蒙古科技大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 人类基因组三核苷酸重复序列的结构和动力学及其在相关领域中应用的研究
- 蔡禄罗辽复贾孟文毛爱华
- 课题瞄准当前DNA序列、结构和动力学研究的国际前沿,在分子水平开展细致的基础理论研究。考虑DNA的静态结构和动力学柔性,建立了DNA构象的统计力学模型。分析计算了各类三核苷酸重复序列的结构和柔性,在分子水平建立与人类遗传...
- 关键词:
- 关键词:基因治疗
- 蛋白质结构型预测的研究和三核苷重复序列的弯曲和柔性的研究
- 该文共分两个部分,第一部分研究了蛋白质和聚类和结构型预测,第二部分研究了在随机扰动下DNA三核苷重复序列的弯曲和柔性.
- 贾孟文
- 关键词:离散量
- 文献传递
- 蛋白质的二级结构和mRNA的二级结构的相关性研究被引量:3
- 2004年
- 利用置信度为95的特征字研究了蛋白质二级结构以及其对应mRNA二级结构,发现蛋白质二级结构和mRNA二级结构有明显的相关性.规则二级结构α-螺旋,β-折叠以及包含有Turn的边界明显倾向于mRNA二级结构的茎区,而避免出现在环区.
- 贾孟文罗辽复刘次全
- 关键词:蛋白质二级结构MRNA二级结构置信度
- 随机扰动下DNA三核苷酸重复序列的弯曲和柔性被引量:1
- 2001年
- 利用统计力学模型讨论了与人类遗传病有关的 DNA三核苷酸重复序列的弯曲和柔性 .提出随机扰动模型来近似表示 DNA序列和蛋白质的相互作用 .发现弯曲很小的三核苷重复序列在有随机扰动的情况下 ,可以出现大角度的弯曲 ,且随扰动强度的加大出现大角度弯曲的概率增加 .求出了十二种三核苷重复序列的柔性及其长度依赖 ,发现当序列长度大于 1 50 bp时 ,柔性的变化开始显著 ,CTG和 CGG具有最大的柔性 .研究了柔性在有随机扰动时下的变化 ,发现在序列上不同位置施加扰动 ,柔性的变化程度不同 ,对于 60 0 bp长的序列 ,在 390
- 贾孟文蔡禄
- mRNA序列、结构、能量和蛋白质二级结构的相关性
- 除了编码氨基酸序列以外,mRNA序列还携带了其它的结构信息,如密码子偏好,二级结构等。本文将从多个角度统计分析mRNA序列和蛋白质二级结构的相关性。论文分为4个部分。
第一部分:为了更好地统计分...
- 贾孟文
- 文献传递
- 预测蛋白质结构型的新方法被引量:1
- 2000年
- 以二级结构含量和其它二级结构参数为基础 ,提出用作 Mahalanobis距离和建立数学模型相结合的方法来预测α型、β型、α+β型和α/β型四种蛋白质结构型的新方法 .
- 贾孟文李前忠
- 关键词:蛋白质
- 16s rRNA的保守字和进化树重建(英文)被引量:3
- 2002年
- 据寡核苷 ( n核苷 )频数差定义进化距离 ,由此构成 1 6 s r RNA进化树 ,当 n=7,8时和实验资料符合很好 ,在寻找出全部进化相关的 7-核苷的基础上 ,本文进一步求得了长度大于 7的保守字 ,它们在一个界别中的诸物种中高度保守 ,并出现于核糖体序列的基本相同的位置上 。
- 罗辽复贾孟文
- 关键词:进化树核糖体进化树进化距离
- 蛋白质结构型预测的研究被引量:3
- 2002年
- 以 nα、nβ、nβαβ、n4α、n4β等五个二级结构参数为基础 ,用离散增量研究了蛋白质的聚类和蛋白质的结构型预测 .α型 ,β型和 αβ型可以很好地分别聚在三个大支中 .蛋白质结构型预测总体预测正确率为 82 % ,用 Self-consistency和 Jake-knife这两种方法测试的结果没有明显的差别 .从结果可以看出利用蛋白质的二级结构参数能较好地体现出各种结构型蛋白质的特点 .
- 贾孟文李前忠
- 关键词:蛋白质聚类二级结构序列Α螺旋Β折叠
- 基因组中基因间的关联被引量:5
- 2000年
- 根据基因中核苷关联短程为主性(D2 为主)的概念,通过比较基因间的D2,定义基因组中的基因关联F,F取值的主要范围为0 和1 间,F~1 表示基因的强关联,F~0 表示关联是无规的.以酵母基因组为例,研究了酵母各条染色体上的基因关联,发现F的最可几值一般在0.8~0.9;证明了基因间存在较强的关联.比较编码区和非编码区,发现非编码区间的关联、非编码区和编码区的关联较编码区间的关联为弱,F值低10% 左右.
- 罗辽复张利绒陈颖丽贾孟文
- 关键词:基因关联基因组非编码区编码区