代平
- 作品数：70 被引量：52H指数：5
- 供职机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金：山东省农业良种工程项目山东省农业重大应用技术创新课题中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学经济管理自动化与计算机技术生物学更多>>
- 凡纳滨对虾高WSSV抗性分子标记15W1及其应用
- 本发明提供了一种凡纳滨对虾高WSSV抗性分子标记15W1及其应用。所述分子标记15W1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述分子标记15W1的第301位点基因型GG为WSSV抗性基因型。本发明还提供了所述的分子标...
- 孟宪红隋娟代平栾生孔杰李旭鹏谭建曹家旺
- 活体对虾生长表型高精度测量系统和方法
- 本发明公开了一种活体对虾生长表型高精度测量系统及方法，采集对虾的侧面图像和背面图像；通过所述侧面图像判断所述对虾的姿态是否满足图像采集条件；确定所述对虾的姿态满足图像采集条件时的背面图像；基于所述背面图像对所述对虾的长度...
- 代平栾生孔杰郑一琨孟宪红罗坤
- 凡纳滨对虾易位子相关蛋白α亚基(TRAPα)基因解析及其与WSSV抗性的关联
- 2024年
- 本研究旨在探讨凡纳滨对虾(Litopenaeusvannamei)易位子相关蛋白α亚基(translocon-associatedproteinalpha,TRAPα)基因特征及其在抗白斑综合征病毒(white spot syndrome,WSSV)中的作用。通过PCR和Sanger测序技术,获得凡纳滨对虾TRAPα的开放阅读框(openreadingframe,ORF)序列,将该基因命名为Lv-trapα,并进行生物信息学分析。采用real-time PCR分析Lv-trapα基因在健康凡纳滨对虾和感染WSSV不同时间点的凡纳滨对虾肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄中的Lv-trapα表达水平。同时,利用重亚硫酸氢盐测序技术(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测健康凡纳滨对虾和感染WSSV后96 h的凡纳滨对虾肝胰腺组织中Lv-trapα基因上游DNA序列的甲基化水平。结果显示,Lv-trapα的ORF全长873 bp,共编码290个氨基酸,预测相对分子质量为32466.4,理论等电点为4.45。多序列比对发现TRAPα蛋白的保守性较高。Lv-trapαDNA序列中有8个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP),其中1个SNP位点处于外显子区域且属于错义突变,其余7个SNP位点处于内含子区域。real-time PCR结果显示,Lv-trapα基因在凡纳滨对虾肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄中均有表达,且在感染WSSV后显著上调表达(P<0.05)。值得注意的是,在感染WSSV后96 h,体内病毒含量不同的凡纳滨对虾肝胰腺中Lv-trapα的表达水平差异显著,高病毒含量组中Lv-trapα的表达水平显著高于低病毒含量组(P<0.05),提示Lv-trapα表达水平和WSSV复制水平存在正相关性。BSP结果显示,Lv-trapα基因上游1个CpG位点(存在于NCBI数据库NW_020872863.1第360336-360337 nt位置)的甲基化水平和Lv-trapα表达水平呈负相关,该CpG位点的甲基化水平和凡纳滨对虾体内WSSV病毒含量也呈负相关。本研究可为深入研究凡纳滨对虾抗WSSV的分子机制和抗病分子育种提供理论参考。
- 王晶晶李旭鹏薛倩曹宝祥曹宝祥栾生隋娟罗坤隋娟谭建代平傅强孔杰高焕陈宝龙
- 关键词：凡纳滨对虾TRAP
- 对虾抗病表型的测定方法及系统
- 本发明公开了一种对虾抗病表型的测定方法及系统，解决现有对虾抗病表型测定过度依赖人力带来的精确性低、效率低、人力成本高等的技术问题。所述方法包括：获取病原感染后养殖的对虾的实时图像；基于所述实时图像确定对虾的实时姿态和实时...
- 代平栾生孟宪红隋娟傅强李旭鹏孔杰罗坤
- 一种用于筛选高饲料利用效率的凡纳滨对虾的标记PVRFI2及其应用
- 本发明公开了一种用于筛选高饲料利用效率的凡纳滨对虾的标记PVRFI2及其应用。所述标记PVRFI2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，其检测引物分别为PVRFI2‑F：TTCCTCCATTCTTTCCG；PVRFI...
- 代平栾生隋娟孔杰孟宪红傅强罗坤
- 一种选育高WSSV抗性凡纳滨对虾群体的分子标记10W4及其应用
- 本发明提供了一种选育高WSSV抗性凡纳滨对虾群体的分子标记10W4及其应用。所述分子标记10W4的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述分子标记10W4的第301位点基因型AA为WSSV抗性基因型。本发明还提供了所...
- 孟宪红隋娟代平栾生孔杰李旭鹏 谭建 曹家旺
- 一种用于鉴定对虾繁殖力的分子标记7W1及其应用
- 本发明提供了一种用于鉴定对虾繁殖力的分子标记7W1及其应用。所述分子标记7W1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，其中第301位碱基G在凡纳滨对虾群体中的等位基因频率≥53.33%。本发明还提供了所述的分子标记7W...
- 隋娟栾生孔杰代平孟宪红罗坤曹家旺谭建陈宝龙
- 凡纳滨对虾高WSSV抗性分子标记15W1及其应用
- 本发明提供了一种凡纳滨对虾高WSSV抗性分子标记15W1及其应用。所述分子标记15W1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述分子标记15W1的第301位点基因型GG为WSSV抗性基因型。本发明还提供了所述的分子标...
- 孟宪红隋娟代平栾生孔杰李旭鹏 谭建 曹家旺
- 选育高繁殖力对虾群体的分子标记27W1及其应用
- 本发明提供了选育高繁殖力对虾群体的分子标记27W1及其应用。所述分子标记27W1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，其中第301位碱基G在凡纳滨对虾高繁殖力群体中的等位基因频率≥98.33%。本发明还提供了所述的分...
- 隋娟栾生孔杰代平孟宪红罗坤曹家旺谭建陈宝龙
- 活体对虾生长表型高精度测量系统和方法
- 本发明公开了一种活体对虾生长表型高精度测量系统及方法，采集对虾的侧面图像和背面图像；通过所述侧面图像判断所述对虾的姿态是否满足图像采集条件；确定所述对虾的姿态满足图像采集条件时的背面图像；基于所述背面图像对所述对虾的长度...
- 代平栾生孔杰郑一琨孟宪红罗坤
